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現(xiàn)代食品科技
題名：De novo 測序技術(shù)在啤酒易感乳桿菌 全基因組研究中的應(yīng)用
作者：劉君彥； 李琳； 李冰
出版年：2015
卷期:11
頁碼:
分類:總論
內(nèi)容摘要:本文應(yīng)用De novo測序技術(shù)對一種未經(jīng)測序的啤酒易感乳桿菌進(jìn)行全基因組研究，包括全基因組遺傳信息的首次獲取以及基因功能的生物信息學(xué)分析與注釋。通過對1株從啤酒中分離獲得的乳桿菌基因組DNA進(jìn)行提取與純化，構(gòu)建符合質(zhì)量要求的測序文庫進(jìn)行De novo測序，通過對De novo測序數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選與質(zhì)量評價，進(jìn)一步對篩選后的數(shù)據(jù)進(jìn)行De novo組裝與結(jié)果評價，最后獲得乳桿菌全基因組序列；在獲得全基因組序列的基礎(chǔ)上，對全基因組序列進(jìn)行基因預(yù)測，并對預(yù)測基因進(jìn)行GO基因功能注釋、COG 基因功能注釋與 KEGG 生物通路注釋，獲取該乳桿菌的基因序列與基因功能信息，為該啤酒易感乳桿菌功能基因的研究與生物信息學(xué)分析提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和技術(shù)參考。